Los investigadores de todo el mundo aumentan la potencia de computación y derrotar al COVID-19

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Los investigadores de todo el mundo están aumentando considerablemente la potencia de computación para la secuenciación del ADN, la investigación celular y otros proyectos destinados a comprender y derrotar a COVID-19.

Los investigadores que lideran el esfuerzo para decodificar COVID-19 dicen que la tecnología es clave para vencer al virus y salvar vidas.

«Cuanto más rápido podamos secuenciar el ADN de los pacientes, más eficazmente podremos utilizar esos datos para rastrear y responder a la pandemia», dijo el Dr. Tom Connor, de la Universidad de Cardiff en Gales. «Tener la información disponible a tiempo para tomar decisiones críticas salvará vidas en última instancia – y los datos que estamos generando ya están siendo retroalimentados en tiempo real a los colegas dentro del NHS y el gobierno».

El Dr. Connor dirige el centro de secuenciación del Consorcio galés COVID-19 Genomics UK que comprende la universidad y el fideicomiso de Salud Pública del NHS de Gales, donde dirige el equipo de bioinformática dentro de la Unidad de Genómica de Patógenos. El proyecto depende de una secuenciación y análisis rápidos y a gran escala. Para hacer esto de forma efectiva, el Dr. Connor necesitaba más potencia de cálculo para la metodología de la Infraestructura de Nube para Bioinformática Microbiana (CLIMB) utilizada en la investigación.

Fue entonces cuando el Dr. Connor aprovechó su larga relación con Dell Technologies. Ahora, la empresa trabaja en estrecha colaboración con la universidad para proporcionar a Dell EMC servidores de alto rendimiento que aumentan significativamente la capacidad del CLIMB para compartir y analizar grandes volúmenes de datos genómicos de COVID-19. Con esta solución, el esfuerzo conjunto de la Universidad y el Servicio Nacional de Salud de Gales tiene el potencial de secuenciar y analizar muestras en un plazo de 24 horas, permitiendo respuestas en tiempo real a los resultados.

«La tecnología es una parte crítica de la investigación de COVID-19 que se está llevando a cabo en este momento en todo el mundo», dijo Thierry Pellegrino, vicepresidente de Cargas y Soluciones de Trabajo Centradas en los Datos de Dell Technologies. «Es crucial para la población de nuestro planeta que los investigadores tengan las herramientas para entender, tratar y combatir este virus. Los investigadores de todo el mundo son verdaderos héroes que realizan un trabajo importante en circunstancias extremas y desconocidas, y no podríamos estar más orgullosos de apoyar sus esfuerzos».

La investigación del Dr. Connor es un ejemplo de los esfuerzos que se están realizando en todo el mundo para vencer a COVID-19.

  • El Instituto de Salud de Berlín, junto con Charité, están trabajando para detectar qué células de los pulmones y los bronquios son objetivos para la infección por COVID-19. Su investigación implica la secuenciación de 60.000 células, una tarea que requiere potentes capacidades de computación. Con Dell Technologies, Intel y System Vertrieb Alexander (SVA), se implementó una solución que incluye servidores Dell EMC, lo que permite a BIH y Charité acelerar su investigación e identificar qué células específicas atacan a COVID-19, un paso fundamental para el desarrollo de tratamientos.

 

  • Dell Technologies proporcionó a uno de sus clientes más antiguos, el Translational Genomics Research Institute (TGen), el acceso a la Supercomputadora Zenith. Esto está ayudando a los esfuerzos de TGen para hacer secuencias a nivel de población, lo que está permitiendo un rápido análisis genómico, mejorando la capacidad de la salud pública para identificar rápidamente qué cepas de COVID-19 están circulando más que otras, qué podría estar causando brotes locales, y a qué velocidad está mutando y cambiando el genoma. Comparando los resultados en el contexto de la información genómica mundial, este programa de secuenciación de COVID-19 podría además informar a los investigadores biomédicos en la búsqueda de mejores objetivos para nuevos tratamientos y vacunas para COVID-19.

 

  • La Universita Degli Studi Di Pisa es pionera en computación de alto rendimiento, y sus científicos dependen de esa infraestructura para la investigación en campos que van desde la astrofísica hasta la informática y la medicina. Como COVID-19 tuvo un impacto significativo en Italia, la universidad duplicó su asociación con el Hospital de Santa Chiara, que realiza investigaciones sobre el virus. La universidad dobló las necesidades del hospital en un esfuerzo continuo para impulsar sus capacidades de almacenamiento en flash y Dell Technologies, con un socio de confianza, TRII, fue capaz de cumplir todos los requisitos a pesar de no poder cumplirlos en persona. Esto permitió que la universidad apoyara la investigación COVID-19 de Santa Chiara mientras procedía con un proyecto de investigación química basado en la IA y apoyaba un servicio compartido multi-nube para agencias administrativas, hospitales y ciudades de la Toscana.

 

  • El Centro de Computación Avanzada de Texas (TACC) de la Universidad de Texas en Austin está utilizando sistemas de computación avanzada de Dell Technologies para comprender cómo se está propagando COVID-19 y cómo rastrear y tratar mejor el virus. El TACC se ha unido al Consorcio de Computación de Alto Rendimiento (HPC) de COVID-19, dando acceso remoto a sus dos supercomputadoras, Frontera y Stampede2, a aproximadamente 100 investigadores que trabajan en la investigación de COVID-19 en áreas como la epidemiología y las vacunas. Un proyecto, dirigido por investigadores de la Universidad de Texas en Austin, está evaluando el impacto de las medidas de distanciamiento social para proporcionar a los encargados de la formulación de políticas información sobre las consecuencias de relajar o reforzar esas medidas. Además, esta investigación es una de las fuentes más destacadas de proyecciones y análisis para los funcionarios nacionales de salud pública.

 

Dell Technologies también apoya activamente al Consorcio de Computación de Alto Rendimiento (HPC) COVID-19, un esfuerzo público y privado único encabezado por la Oficina de Política Científica y Tecnológica de la Casa Blanca y el Departamento de Energía de los Estados Unidos para reunir a líderes del gobierno federal, la industria y el mundo académico que ofrecen voluntariamente tiempo y recursos de computación gratuitos en sus máquinas de clase mundial.

Visite la Comunidad HPC de Dell Technologies para descubrir cómo los investigadores, informáticos, tecnólogos e ingenieros están trabajando conjuntamente con Dell Technologies para promover el avance de soluciones HPC innovadoras y potentes.

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